Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLIRPQ9GZT3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms