Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1EQ9GZS1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms