Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms