Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC115619.1-201ENST00000567376 1605 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-8Q9BYQ0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms