Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFHD1Q9BUP0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms