Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
MESP1Q9BRJ9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MESP1Q9BRJ9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms