Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPS8Q99627 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPS8Q99627 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPS8Q99627 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPS8Q99627 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPS8Q99627 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPS8Q99627 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPS8Q99627 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPS8Q99627 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPS8Q99627 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS8Q99627 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS8Q99627 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS8Q99627 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS8Q99627 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS8Q99627 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS8Q99627 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS8Q99627 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS8Q99627 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS8Q99627 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS8Q99627 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS8Q99627 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS8Q99627 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS8Q99627 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS8Q99627 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS8Q99627 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms