Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LMTK3Q96Q04 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMTK3Q96Q04 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms