Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms