Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C18orf8Q96DM3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C18orf8Q96DM3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms