Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms