Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF3C6Q969F1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms