Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113Q902F9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113Q902F9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113Q902F9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113Q902F9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113Q902F9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113Q902F9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113Q902F9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113Q902F9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HERVK_113Q902F9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113Q902F9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms