Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms