Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CSNK2A3Q8NEV1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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