Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms