Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms