Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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CLDN19Q8N6F1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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CLDN19Q8N6F1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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CLDN19Q8N6F1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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CLDN19Q8N6F1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLDN19Q8N6F1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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