Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
WDR53Q7Z5U6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms