Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms