Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
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