Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPN12Q6ZSI9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms