Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms