Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms