Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms