Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S6

FBXO42, F-box only protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO42Q6P3S6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO42Q6P3S6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms