Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms