Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms