Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms