Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ATL3Q6DD88 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL3Q6DD88 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms