Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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SAMD13Q5VXD3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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SAMD13Q5VXD3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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SAMD13Q5VXD3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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SAMD13Q5VXD3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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SAMD13Q5VXD3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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SAMD13Q5VXD3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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SAMD13Q5VXD3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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SAMD13Q5VXD3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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SAMD13Q5VXD3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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