Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1QL3Q5VWW1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
C1QL3Q5VWW1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1QL3Q5VWW1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1QL3Q5VWW1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1QL3Q5VWW1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QL3Q5VWW1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QL3Q5VWW1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QL3Q5VWW1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QL3Q5VWW1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QL3Q5VWW1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms