Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GARNL3Q5VVW2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms