Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
C9orf135Q5VTT2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms