Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.33■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.32■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.32■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.32■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.32■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.31■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.31■■□□□ 1
STRIP1Q5VSL9 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms