Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CC2D1BQ5T0F9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms