Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms