Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms