Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CEP170Q5SW79 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms