Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP78Q5JTW2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms