Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms