Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDNFQ49AH0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms