Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HFEQ30201 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HFEQ30201 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HFEQ30201 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HFEQ30201 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms