Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL40Q2TBA0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms