Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms