Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
FAM187BQ17R55 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms