Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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