Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ECM1Q16610 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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ECM1Q16610 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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ECM1Q16610 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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ECM1Q16610 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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ECM1Q16610 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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ECM1Q16610 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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ECM1Q16610 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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ECM1Q16610 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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ECM1Q16610 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
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ECM1Q16610 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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ECM1Q16610 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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ECM1Q16610 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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ECM1Q16610 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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