Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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SNAPC1Q16533 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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