Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEBPEQ15744 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms